有給を打刻したい時は、「休暇」ボタンより設定を行います。

備考欄に「有給」の語句を入力すると休暇のステータスになり、
集計ソフトで打刻データを読み込んだ時に欠勤ではなく有給と認識されます。

詳しい操作方法はこちらから

http://www.de-net.com/manual/timecard_school_dx/sousa/dakoku11_holi_yukyu.htm

※有給の管理機能はありません。